Im Mittelpunkt der vorliegenden Arbeit stand die Untersuchung der Bildung suboptimaler, metastabiler Replikationsintermediate durch die sequentielle Faltung von Viroidtranskripten. Durch die Klonierung von PSTVd-cDNA-Matrizen zur Herstellung von --strängigen RNA-Molekülen mit den in vivo vorliegenden 5'-Nukleotiden ergab sich zum ersten Mal die Möglichkeit, die bei der Viroidreplikation durch die Transkription von +- in --strängige RNA entstehende Strukturverteilung mittels TGGE zu analysieren. Dazu wurden in vitro-Transkriptionsbedingungen gewählt, die den in vivo-Bedingungen annähernd entsprechen. Die erhaltenen Strukturverteilungen wurden daraufhin zudem auf die Anwesenheit des für die Viroidreplikation als essentiell postulierten HPII als Strukturmotiv für die Erkennung durch wirtseigene Faktoren untersucht.