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Ergebnisse

Die Motivation zu dieser Arbeit ergab sich aus den Ergebnissen von Fels (1997), der die Nukleotidpositionen A111 und A325 als Startstellen für die Viroid-Replikation durch die PolymeraseII nachweisen konnte. Die Bildung metastabiler RNA-Strukturen von Viroid-Transkripten in Abhängigkeit von der gewährten Transkriptionsdauer wurde schon von Repsilber (1995) und Rachen (1997) untersucht. Jedoch konnten sie ihre Untersuchungen noch nicht an PSTVd-cRNA-Transkripten mit den in vivo-Startstellen durchführen. Im ersten Teil dieser Arbeit sollten daher Transkriptionsvektoren konstruiert werden, mit denen ausgehend von den natürlichen Startstellen --strängige Vollängentranskripte hergestellt werden können. Es wurde dann die zeitliche Entwicklung der Strukturverteilung bei der Transkription untersucht, wobei ausschließlich die Transkriptionsdauer, d.h. die Inkubationszeit der Ansätze variiert wurde. In weiterführenden Experimenten sollten die RNA-Transkripte, die die HaarnadelstrukturII (HPII) als Strukturmotiv enthalten detektiert werden. Zum Vergleich mit den experimentellen Ergebnissen wurden abschließend thermodynamische Strukturvorhersagen mit dem Computerprogramm ,,LinAll`` angestellt.



Unterabschnitte

S. Gräf